Les principaux axes de recherche abordés par le centre concernent l’archéologie historique, la production et la culture matérielle, la cartographie archéologique et l’archéo-environnement.

Ses projets de recherche retenus, très diversifiés, se rapportent aux domaines de la prospection et de l’inventaire, à des études de cas, au catalogage des collections archéologiques ou de monuments, à des Systèmes d’Information Géographique en archéologie, à la modélisation et restitution archéologique. Les objectifs de ces projets, les modalités de leur mise en place constituent un facteur innovant par rapport aux interventions ponctuelles au niveau local (diagnostics, constats, interventions d’urgence …)

Le centre  constitué de quatre divisions et dispose de 17 équipes de recherches qui interviennent dans différents domaines.